1、认证性质：最大的区别是CE认证是欧盟的强制性认证，出口欧盟成员国，只要是在CE范围内的所有产品必须贴CE标志。GS是德国自愿性认证，也被其他欧盟成员国认可。如果通过GS认证的产品会相对来说更有竞争力。
2、证书年费：CE认证无须缴年费;GS认证必须缴年费。
3、工厂审核：CE认证无须工厂审核;GS认证申请需工厂审核且获得证书后工厂需年审。
4、适用标准：CE是针对电磁兼容以及安全方面的测试;而GS主要是针对产品安全方面的一些要求。
5、重新获得认证：CE认证是一次性认证，无期限限制;GS认证5年有效期满后，产品需重测试再次申请。
6、市场认知度：CE是工厂对产品符合性的自我宣告,公信力及市场接受度低;GS由授权测试单位来核发GS标志，公信力及市场接受度高。
最后，就是认证费用以及周期的区别。